ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΕΙΣ:
Lectures
-
- Lecture 1 – Introduction to metabolic engineering
- Lecture 2 – Cell metabolism
- Lecture 3 – Models
- Lecture 4 – Equilibriums
- Lecture 5 – Metabolic pathways regulation
- Lecture 6 – Examples
- Lecture 7 – Metabolic pathway synthesis
- Lecture 8 – Metabolic fluxes analysis
- Lectures 9&10 – Metabolic control analysis
- Μπορεί η μεταβολική μηχανική να αποτελέσει ένα υπερόπλο ενάντια στον καρκίνο; Να μελετηθεί ο τρόπος ανάπτυξης των καρκινικών κυττάρων και ο τρόπος με τον οποίο η χρήση εργαλείων της μεταβολικής μηχανικής μπορεί να αναστρέψει την αύξηση αυτή.
- Ανάπτυξη μαθηματικού μοντέλου για το μεταβολισμό της Ινσουλίνης στα κύτταρα του παγκρέατος στο υπολογιστικό περιβάλλον της R, βασιζόμενοι στην εργασία του Ahmad R. Sedaghat et al. 2002 (https://doi.org/10.1152/ajpendo.00571.2001)
- Πως οι εφαρμογές (NLP-NLU) παραγωγής κειμένου μπορούν να βελτιώσουν την αντίληψη μας και την κατανόηση μας γύρω από τις βιολογικές και μεταβολικές διεργασίες; Γράψτε την ανάλυση σας στηριζόμενοι σε βιβλιογραφικές πηγές και εργασίες της βιβλιογραφίας καθώς επίσης και τις δικές σας προτάσεις για έρευνα βασιζόμενοι στη βιβλιογραφική ανασκόπηση που κάνατε.
- Ανάλυση ροών σύνθεσης και βελτιστοποιήση της παραγωγής του α-Κετλουταρικού οξέος και του οξαλικού οξέος (σελίδα 14 , διαφάνειες 6ου μαθήματος) από γλυκόζη – [picture].Υπολογιστικό μέρος:
-
- Θα γίνει ο σχεδιασμός του μεταβολικού μονοπατιού και εν συνεχεία θα πραγματοποιηθεί βελτιστοποιήση της παραγωγής. Οι υπολογισμοί θα πραγματοποιήθούν με τη χρήση του λογισμικού MATLAB (SimBiology και Optimization toolbox).
Βιβλιογραφικό μέρος:
-
- Τα αποτελέσματα θα ερμηνευτούν και θα εξεταστεί η δυνατότητα και ο τρόπος παρέμβασης σε κάθε στάδιο της παραγωγής.
Απαραίτητες γνώσεις:
- βασικό επίπεδο MATLAB.
-
- Να μελετηθεί η εφαρμοσιμότητα της βιομοριακής και μεταβολικής μηχανικής σε σημαντικές δραστηριότητες όπως η βιοενέργεια η αγροτική παραγωγή και η παραγωγή πρώτων υλών για τη βιομηχανία.